Фильм снят по мотивам одноимённого произведения Яна Ларри. Эта история приключилась с братом и сестрой, мальчиком по имени Карик и девочкой Валей. Однажды утром дети проснулись и решили пойти к Ивану Гермагеновичу, чтобы посмотреть на чудеса. Оказывается, Иван Гермагенович может слона превратить в муху, а человека в человечка. Ребята пришли к этому ученому домой и стали разглядывать разные изобретения. А потом Валя увидела на подоконнике банку с яркими и ароматными шариками, которые по вкусу очень напоминали конфеты. Дети съели всего по одному шарику и превратились в крохотных человечков. Вот тут и начинаются настоящие необыкновенные приключения Карика и Вали.